Modelización estadística para la estimación y predicción de la incidencia de Covid-19 en España

  • David Moriña Departamento de Econometría, Estadística y Economía Aplicada - Riskcenter-IREA, Universitat de Barcelona, España
  • Alessandra Ybargüen Departamento de Econometría, Estadística y Economía Aplicada - Riskcenter-IREA, Universitat de Barcelona, España
Palabras clave: modelización estadística, series temporales, datos infraregistrados, enfermedades infecciosas, covid-19

Resumen

Introducción: Basar procesos de toma de decisiones en datos que contienen errores e imprecisiones es inevitable en muchos de contextos por diferentes razones. La situación derivada de la pandemia mundial de COVID-19 es un claro ejemplo, donde los datos proporcionados por fuentes oficiales no siempre fueron fiables debido a problemas de recopilación de datos y a la alta proporción de casos asintomáticos. Objetivos: Cuantificar la gravedad de la información errónea en una serie temporal y reconstruir la evolución más probable del proceso, así como una discusión sobre los métodos estadísticos más adecuados para obtener predicciones en este contexto. Métodos: Se propone el uso de un modelo autoregresivo con heterocedasticidad condicional y estimación de los parámetros mediante Bayesian synthetic likelihood. Resultados: Solo alrededor del 51% de los casos de COVID-19 en el período 23 de febrero de 2020 al 27 de febrero de 2022 se notificaron en España, observándose también diferencias relevantes en la intensidad del subregistro entre comunidades autónomas. Conclusión: La metodología propuesta proporciona a los tomadores de decisiones en salud pública una valiosa herramienta para mejorar la evaluación de la evolución de una enfermedad bajo diferentes escenarios, ya que permite generar predicciones realistas en este contexto.

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Citas

Alfonso, J. H., Løvseth, E. K., Samant, Y. and Holm, J. (2015). Work-related skin diseases in Norway may be underreported: Data from 2000 to 2013. Contact Dermatitis, 72(6), 409-412. https://doi.org/10.1111/cod.12355

Arendt, S., Rajagopal, L., Strohbehn, C., Stokes, N., Meyer, J., & Mandernach, S. (2013). Reporting of foodborne illness by U.S. consumers and healthcare professionals. International journal of environmental research and public health, 10(8), 3684-3714. https://doi.org/10.3390/ijerph10083684

Azmon, A., Faes, C., & Hens, N. (2014). On the estimation of the reproduction number based on misreported epidemic data. Statistics in medicine, 33(7), 1176-1192. https://doi.org/10.1002/sim.6015

Bernard, H., Werber, D., & Höhle, M. (2014). Estimating the under-reporting of norovirus illness in Germany utilizing enhanced awareness of diarrhoea during a large outbreak of Shiga toxin-producing E. coli O104: H4 in 2011—A time series analysis. BMC Infectious Diseases, 14(1), 116-116. https://doi.org/10.1186/1471-2334-14-116

Fernández-Fontelo, A., Moriña, D., Cabaña, A., Arratia, A. and Puig, P. (2020). Estimating the real burden of disease under a pandemic situation: The SARS-CoV2 case. PLoS ONE, 15, e0242956. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0242956

Fernández‐Fontelo, A., Cabaña, A., Joe, H., Puig, P. and Moriña, D. (2019). Untangling serially dependent underreported count data for gender‐based violence. Statistics in Medicine, 38(22), 4404-4422. https://doi.org/10.1002/sim.8306

Fernández-Fontelo, A., Cabaña, A., Puig, P. and Moriña, D. (2016). Under-reported data analysis with INAR-hidden Markov chains. Statistics in Medicine, 35(26), 4875-4890. https://doi.org/10.1002/sim.7026

Gibbons, C. L., Mangen, M.-J. J., Plass, D., Havelaar, A. H., Brooke, R. J., Kramarz, P., Peterson, K. L., Stuurman, A. L., Cassini, A., Fèvre, E. M., Kretzschmar, M. E. E., & Burden of Communicable diseases in Europe (BCoDE) consortium. (2014). Measuring underreporting and under-ascertainment in infectious disease datasets: A comparison of methods. BMC public health, 14(1), 147. https://doi.org/10.1186/1471-2458-14-147

Harkener, S., Stausberg, J., Hagel, C., & Siddiqui, R. (2019). Towards a Core Set of Indicators for Data Quality of Registries. Studies in health technology and informatics, 267, 39-45. https://doi.org/10.3233/SHTI190803

Hastie, T. J., & Tibshirani, R. J. (1990). Generalized Additive Models. CRC Press.

Hochreiter, S., & Schmidhuber, J. (1997). Long Short-Term Memory. Neural Computation, 9(8), 1735-1780. https://doi.org/10.1162/neco.1997.9.8.1735

Kodra, Y., Weinbach, J., Posada-De-La-Paz, M., Coi, A., Lemonnier, S. L., van Enckevort, D., Roos, M., Jacobsen, A., Cornet, R., Ahmed, S. F., Bros-Facer, V., Popa, V., van Meel, M., Renault, D., von Gizycki, R., Santoro, M., Landais, P., Torreri, P., Carta, C., … Taruscio, D. (2018). Recommendations for improving the quality of rare disease registries. International Journal of Environmental Research and Public Health, 15(8). https://doi.org/10.3390/ijerph15081644

Magal, P., & Webb, G. (2018). The parameter identification problem for SIR epidemic models: Identifying unreported cases. Journal of Mathematical Biology, 77(6-7), 1629-1648. https://doi.org/10.1007/s00285-017-1203-9

Moriña, D., Fernández-Fontelo, A., Cabaña, A., Arratia, A., & Puig, P. (2023). Estimated Covid-19 burden in Spain: ARCH underreported non-stationary time series. BMC Medical Research Methodology, 23, 75. https://doi.org/10.1186/s12874-023-01894-9

Moriña, D., Fernández-Fontelo, A., Cabaña, A., Arratia, A., Ávalos, G., & Puig, P. (2021). Cumulated burden of Covid-19 in Spain from a Bayesian perspective. European Journal of Public Health, 31(4), 917-920. https://doi.org/10.1093/eurpub/ckab118

Moriña, D., Fernández-Fontelo, A., Cabaña, A., & Puig, P. (2021). New statistical model for misreported data with application to current public health challenges. Scientific Reports, 11(1), 23321. https://doi.org/10.1038/s41598- 021-02620-5

Moriña, D., Fernández-Fontelo, A., Cabaña, A., Puig, P., Monfil, L., Brotons, M., & Diaz, M. (2021). Quantifying the under-reporting of uncorrelated longitudal data: The genital warts example. BMC Medical Research Methodology, 21(1), 6-6. https://doi.org/10.1186/s12874-020-01188-4

Rosenman, K. D., Kalush, A., Reilly, M. J., Gardiner, J. C., Reeves, M., & Luo, Z. (2006). How much work-related injury and illness is missed by the current national surveillance system? Journal of occupational and environmental medicine / American College of Occupational and Environmental Medicine, 48(4), 357-365. https://doi.org/10.1097/01.jom.0000205864.81970.63

Sherratt, K., Gruson, H., Grah, R., Johnson, H., Niehus, R., Prasse, B., Sandmann, F., Deuschel, J., Wolffram, D., Abbott, S., Ullrich, A., Gibson, G., Ray, E. L., Reich, N. G., Sheldon, D., Wang, Y., Wattanachit, N., Wang, L., Trnka, J., … Funk, S. (2023). Predictive performance of multi-model ensemble forecasts of Covid-19 across European nations. eLife, 12, e81916. https://doi.org/10.7554/eLife.81916

Sohrabi, C., Alsafi, Z., O’Neill, N., Khan, M., Kerwan, A., Al-Jabir, A., Iosifidis, C., & Agha, R. (2020). World Health Organization declares Global Emergency: A review of the 2019 Novel Coronavirus (Covid-19). International journal of surgery (London, England), 76, 71-76. https://doi.org/10.1016/j.ijsu.2020.02.034

Stocks, T., Britton, T., & Höhle, M. (2018). Model selection and parameter estimation for dynamic epidemic models via iterated filtering: Application to rotavirus in Germany. Biostatistics. https://doi.org/10.1093/biostatistics/kxy057

Stoner, O., Economou, T. and Drummond Marques da Silva, G. (2019). A Hierarchical Framework for Correcting Under-Reporting in Count Data. Journal of the American Statistical Association, 114(528), 1481-1492. https://doi.org/10.1080/01621459.2019.1573732

Taylor, S. J., & Letham, B. (2018). Forecasting at Scale. The American Statistician, 72(1), 37-45. https://doi.org/10.1080/00031305.2017.1380080

Winkelmann, R. (1996). Markov chain Monte Carlo analysis of underreported count data with an application to worker absenteeism. Empirical Economics, 21(4), 575-587. https://doi.org/10.1007/BF01180702

Zhao, S., Musa, S. S., Lin, Q., Ran, J., Yang, G., Wang, W., Lou, Y., Yang, L., Gao, D., He, D., & Wang, M. H. (2020). Estimating the Unreported Number of Novel Coronavirus (2019-nCoV) Cases in China in the First Half of January 2020: A Data-Driven Modelling Analysis of the Early Outbreak. Journal of Clinical Medicine, 9(2), 388. https://doi.org/10.3390/jcm9020388

Publicado
2024-01-06
Cómo citar
Moriña, D., & Ybargüen, A. (2024). Modelización estadística para la estimación y predicción de la incidencia de Covid-19 en España. REVISTA ESPAÑOLA DE COMUNICACIÓN EN SALUD, 54-59. https://doi.org/10.20318/recs.2024.7951
Sección
Artículos